Weltweit grösstes Protein-Inventar für Modellorganismen

Das «Center for Model Organism Proteoms» der Universität Zürich verfügt weltweit über das grösste Protein-Inventar von Modellorganismen. Die Datensammlung wird in Zukunft von Tausenden Forschern genutzt und stellt einen grossen Wert für die biologische Grundlagenforschung dar.

Nematoden (Würmer), Drosophila (Taufliege), Arabidopsis (Ackerschmalwand) – dies sind die von der Forschung am häufigsten eingesetzten Modellorganismen. Modellorganismen dienen dazu, grundlegende biologische Vorgänge zu untersuchen. Das 2005 ins Leben gerufene «Center for Model Organism Proteoms» an der MNF der Universität Zürich hat sich das Ziel gesetzt, das Proteom, d.h. das vollständige Protein-Inventar dieser drei wichtigsten Modellorganismen zu erfassen. Die Zusammensetzung der Proteine in einer Zelle ist sehr unterschiedlich: Sie hängt u.a. vom Zelltyp und dem Entwicklungszustand des Organismus ab. Der Informationsgehalt des Protein-Inventars ist um Grössenordnungen komplexer als jener des Genoms eines Organismus. Ein Protein-Inventar ist daher von unschätzbarem Wert für das vertiefte Verständnis der biologischen Vorgänge in einer Zelle. Vollständig erfasste Protein-Inventare, wie sie das «Center for Model Organism Proteoms» anstrebt, bedeuten für die Forschung eine fundamentale Erleichterung.

C. elegans Protein-Inventar nahezu vollständig erfasst
Professor Michael Hengartner und seiner Forschungsgruppe ist es vor kurzem gelungen, das Protein-Inventar des Nematoden Caenorhabditis elegans zu einem Grossteil zu erfassen. Zusammen mit den Forschungsgruppen von Professor Konrad Basler und Professor Ruedi Aebersold an der MNF der UZH verglichen die Wissenschafter anschliessend erstmals die Proteinzusammensetzung von zwei unterschiedlichen Tierarten: Sie stellten fest, dass die Proteinzusammensetzung von Rundwurm C. elegans und Taufliege Drosophila melanogaster trotz der grossen anatomischen Unterschiede überraschend ähnlich ist. Da die Proteine von C. elegans und Drosophila darüber hinaus auch gewisse Ähnlichkeiten mit menschlichen Proteinen aufweisen, ist die Vermutung nahe liegend, dass ein Proteom-Vergleich von Mensch und Wurm ähnliche Ergebnisse bringen wird.

Grösste Modellorganismen-Proteom-Datensammlung weltweit
Zusammen mit den schon erfassten Protein-Inventaren von Drosophila und Arabidopsis verfügt das«Center for Model Organism Proteoms» der UZH nun über die grösste Modellorganismen-Proteom-Datensammlung der Welt. Die Daten können in Zukunft weltweit von Tausenden Forschern aktiv genutzt werden und stellen einen grossen Wert für die biologische Grundlagenforschung dar.

Originalbeitrag:
Sabine P. Schrimpf, Manuel Weiss, Lukas Reiter, Christian H. Ahrens, Marko Jovanovic, Johan Malmström, Erich Brunner, Sonali Mohanty, Martin J. Lercher, Peter E. Hunziker, Ruedi Aebersold, Christian von Mering & Michael O. Hengartner: Comparative Functional Analysis of the Caenorhabditis elegans and Drosophila melanogaster Proteoms. Plos Biology, http://biology.plosjournals.org